Issue d’Omicron comme les sous-variants BA.4 et BA.5 actuellement actifs dans l’Hexagone, cette nouvelle souche apparue en Asie est extrêmement complexe, puisqu’elle est « équipée » de cinq mutations. Ces « bras armés » lui permettent de contourner notre immunité, qu’elle soit acquise ou vaccinale, et d’infecter plus facilement les organismes.
Identifié le mois dernier à Singapour où il est rapidement devenu majoritaire, le nouveau variant représenterait « 5 % des échantillons séquencés » en Australie, selon Antoine Flahault, médecin épidémiologiste et directeur de l’Institut en santé globale de la faculté de médecine de Genève, interrogé par le quotidien La Dépêche du Midi.
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Très invasif, ce sous-variant « issu d’une combinaison de deux sous-lignages d’Omicron » est non seulement contagieux, mais également capable de coexister avec d’autres souches pour affaiblir davantage les personnes touchées.
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Malgré leurs craintes face à cette menace, les épidémiologistes estiment que les personnes vaccinées bénéficieront toujours d’une protection suffisante pour éviter d’être atteintes par XBB ou de développer des formes graves de Covid.
TCS = trouble de la communication sociale (24/09/2014).
Deux rats domestiques ont été contaminés par le variant Omicron du SARS-CoV-2 à partir d’une personne infectée, rapportent des chercheurs français dans un article paru le 13 octobre 2022 sur le site de prépublication bioRxiv. L’un des rongeurs a développé des symptômes sévères.
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Alors que les premiers variants du SARS-CoV-2 étaient incapables d’infecter les rongeurs, les choses ont changé au cours de l’évolution du virus au sein de la population humaine au fil du temps. De multiples variants préoccupants ont émergé, devenus capables d’infecter des rongeurs dans des conditions expérimentales. Cet élargissement de l’ensemble des espèces susceptibles d’être infectées (ce que l’on appelle le spectre d’hôte) a été associé à l’émergence de changements dans la protéine spike, notamment à l’apparition de la mutation N501Y.
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« La possibilité que des rongeurs puissent héberger le SARS-CoV-2 et transmettre le virus à des congénères est en faveur de l’hypothèse selon laquelle des rongeurs sauvages peuvent devenir des réservoirs secondaires du SARS-CoV-2, dans lesquels le virus peut évoluer différemment que chez l’homme », déclarent les chercheurs.
Ces virologues et biologistes moléculaires estiment par ailleurs que les rongeurs devraient faire l’objet d’une surveillance épidémiologique aussi bien au niveau de l’interface homme-animal que dans leur environnement, en l’occurrence à la fois dans les grandes villes et dans les zones rurales.
De fait, l’hypothèse d’une évolution différente du virus dans des rongeurs de celle observée chez l’homme a été soulevée pour expliquer la détection de lignages atypiques (dits « cryptiques ») de SARS-CoV-2 dans les eaux usées.
TCS = trouble de la communication sociale (24/09/2014).
Le variant Omicron apparaît mieux équipé pour reconnaître le récepteur cellulaire ACE2 de la souris que celui de l’homme, rapportent des chercheurs américains dans une étude publiée le 18 octobre 2022 dans les Comptes rendus de l’Académie américaine des sciences (PNAS). On rappelle que le coronavirus SARS-CoV-2 se fixe par l’intermédiaire de la région RBD (receptor binding domain, domaine de liaison au récepteur) de sa protéine spike au récepteur cellulaire ACE2 qui lui sert de porte d’entrée dans les cellules qu’il infecte.
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Parmi les hypothèses, on a évoqué la possibilité que ce variant ait pu émerger dans un organisme humain qui aurait hébergé le SARS-CoV-2 pendant une très longue durée. Au sein d’un individu immunodéprimé, l’infection persistante par le SARS-CoV-2 aurait ainsi pu favoriser l’émergence d’un virus génétiquement distinct du virus qui l’avait infecté au départ et qui aurait acquis au fil du temps une multitude de mutations.
Une autre hypothèse postule que l’origine du variant Omicron soit animale et que la constellation de mutations dont il est porteur soit la résultante d’une adaptation préalable chez un animal. En d’autres termes, Omicron aurait pu infecter un hôte animal, au sein duquel il aurait acquis une masse critique de mutations, avant de franchir la barrière d’espèce dans l’autre sens pour se transmettre à l’homme.
TCS = trouble de la communication sociale (24/09/2014).
Le sous-lignage BQ.1 a lui-même évolué, aboutissant à l’émergence d’un nouveau sous-variant désigné BQ.1.1 (qui renferme en plus la mutation R346T), probablement apparu en Afrique de l’Ouest, avant de se diffuser en Europe et dans d’autres régions dans le monde.
Les premières séquences des sous-lignages BQ.1 et BQ.1.1 remontent à la mi-juillet 2022 au Nigeria et ont depuis été rapportées dans de nombreux autres pays : en Europe, aux États-Unis et au Japon. BQ.1.1 renferme les mutations K444T, L452R, N460K, F486V et R346T dans sa protéine spike.
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Selon la base de données génomiques GISAID, les pays européens, hors communauté européenne, dans lesquels on dénombre le plus grand nombre de cas associés à BQ.1 et BQ.1.1, sont la Suisse (9 %) et le Royaume-Uni (8 %).
Aux États-Unis, on estime que le sous-variant BQ.1.1 représentait environ 11 % des cas de Covid-19 durant la semaine 42 (du 17 au 23 octobre 2022). Il est possible que ce nouveau sous-variant circule également à des niveaux élevés ailleurs dans le monde, sachant que l’on ne dispose pas de données de séquençage dans de nombreux pays et territoires.
Le taux de croissance quotidien de BQ.1 et BQ.1.1 est significativement plus élevé que celui de BA.5. En France, celui de BQ.1.1 est de 11 jours, de 13 jours en Allemagne, de 10 jours au Royaume-Uni et en Israël.
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« Au fur et à mesure que le SARS-CoV-2 se diversifie du fait d’une circulation virale continue, la capacité de vacciner contre des variants dominants circulants peut être encore plus compromise », soulignent ces chercheurs. Et de conclure qu’il est essentiel d’améliorer la formulation des vaccins à ARN messager afin de les rendre efficaces sur un éventail plus large de variants, voire sur l’ensemble des coronavirus (vaccin pan-coronavirus), tout en surveillant étroitement l’émergence de variants pouvant potentiellement être plus transmissibles et plus pathogènes.
TCS = trouble de la communication sociale (24/09/2014).
Chez de rares patients immunodéprimés, l’infection par le SARS-CoV-2 peut entraîner une infection chronique pendant plusieurs semaines ou plusieurs mois. On dispose de peu de données sur la prise en charge thérapeutique de ces patients, qui pourraient bénéficier d’associations de médicaments ou de traitements pendant une durée plus longue. Il importe alors de savoir s’il s’agit d’une infection persistante ou d’une réinfection.
Des médecins britanniques rapportent, dans un article publié en ligne le 3 novembre 2022 dans la revue Clinical Infectious Diseases, plusieurs cas cliniques illustrant l’intérêt que peut représenter le séquençage du génome viral entier chez ces patients. En effet, la présence de certaines mutations ou l’identification de certains variants du SARS-CoV-2 peut compliquer les décisions thérapeutiques du fait d’une moindre sensibilité aux traitements prescrits ou envisagés.
Dans un tel contexte, ces chercheurs soulignent l’intérêt d’avoir recours au séquençage du génome entier sur des prélèvements biologiques réalisés à des temps différents chez un même patient, pour différencier une infection prolongée d’une nouvelle infection et ainsi guider le choix d’un traitement adapté.
TCS = trouble de la communication sociale (24/09/2014).
On aurait pu sauver plus d’un million de vies à travers le monde, si les vaccins contre la COVID avaient été distribués plus vite et plus équitablement en 2021, dans les pays à faibles revenus.
C’est ce qui ressort d’un modèle mathématique: une projection faite à partir des données provenant de 152 pays. L’épidémiologiste britannique Sam Moore et ses collègues de l’Université de Warwick, en Angleterre, ont en particulier analysé les données sur la « mortalité excédentaire » —c’est-à-dire le nombre de décès qui, pendant un mois donné, dépasse la moyenne des mêmes mois des années précédentes— parallèlement avec les chiffres sur le niveau de disponibilité des vaccins dans chaque pays, et avec le taux de mortalité associé au virus, ou à son variant du moment. Les résultats de ces calculs—« nous estimons qu’un scénario de partage complet des vaccins aurait empêché 295,8 millions d’infections et 1,3 million de décès »— sont parus le 27 octobre dans Nature Medicine.
TCS = trouble de la communication sociale (24/09/2014).
Un long et très documenté article de ma collègue Solenn de Royer revient sur le rôle d’Agnès Buzyn aux débuts de la crise provoquée par le Sars-Cov-2. Rédigé après avoir pris connaissance d’un « journal » de l’ancienne ministre de la Santé et un échange avec elle, il éclaire d’un jour cru, et surtout précis, cette période, entre fin décembre 2019 et mi-mars 2020 où selon le Britannique Richard Horton, le rédacteur en chef du Lancet, une revue scientifique médicale internationale, les dirigeants européens ont, tous, faillis.
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Agnès Buzyn n’a pas toujours été la plus adroite dans son expression publique durant cette période décisive, notamment lorsqu’elle cède à une pression insensée et violente d’Emmanuel Macron pour prendre la succession de Benjamin Griveaux comme tête de liste pour les élections municipales à Paris, lors du week-end du 15 et 16 février. Elle fournit, selon l’article du Monde, nombre de preuves de ses démarches insistantes, notamment fin janvier et début février, pour faire prendre conscience au Premier ministre, Edouard Philippe, et au Président de la République, de l’ampleur de la menace épidémique et de la nécessité de préparer la population à des mesures drastiques de protection. La suite fut un désastre, puisque, complètement obnubilés par l’enjeu politique des élections municipales, les deux têtes de l’exécutif ne se résigneront à ces mesures qu’à la mi-mars, au lendemain du deuxième tour, trop tard pour éviter des milliers de morts dues à ce retard à l’allumage.
Jusqu’à ce que Agnès Buzyn révèle la teneur des échanges qu’elle avait avec Edouard Philippe et Emmanuel Macron, et notamment les refus de ce dernier de la recevoir durant la période clé – de fin janvier à la mi-février – il était difficile de discerner les différentes responsabilités du trio. Il est désormais clair que lorsque la Cour de Justice de la République la met en examen et se contente d’un statut de témoin assisté pour Edouard Philippe et… évidemment rien pour le Président en exercice, il y a tromperie. Durant cette période clé, la ministre tente d’alerter et de faire bouger la tête de l’exécutif, et elle n’est pas écoutée. Puis, décision dramatique, elle est éjectée du ministère pour tenter un coup politique local – mais un local symboliquement très fort puisqu’il s’agit de Paris – au bénéfice d’un attentisme aux conséquences désastreuses.
TCS = trouble de la communication sociale (24/09/2014).
Question à la cantonade : le port du masque est-il encore utile ? La question est bête, puisqu'il y a toujours des situations où ça l'est. (Lieu de soin, typiquement.)
Ce que je veux demander, c'est si, moi, qui n'ai pas de problème d'immunité et n'ait personne dans mon entourage qui en ait, qui suis vacciné trois fois, a encore une bonne raison de porter le masque.
J'aime bien porter le masque. Aussi fou que ça puisse paraître. Mais c'est beaucoup plus compliqué d'être compris : je n'ai pas vraiment réflexe de hausser la voix, même dans les environnements bruyants.
En espérant avoir été utile et constructif. Reste ouvert à nouveaux éléments, pour mieux être, mieux faire.
Identifié HQI, après suspicions de TSA. Troubles anxio-dépressifs chroniques. TPOC?
Je pense que tant qu'il n y a pas de mesures "obligatoires", chacun est libre de faire ce qu'il souhaite. Moi je continue de le porter, dans la rue et dans les lieux publics. Les fois où je l'enlève exceptionnellement, c'est en extérieur dans des endroits où il n y a personne en ville et en pleine nature/montagne.
Lorsque j'ai des RDV, médicaux, paramédicaux ou autre, je préviens à l'avance la personne que lorsqu'on se verra, je maintiendrai le port du masque et que ça m'arrangerait que ce soit réciproque pour la personne en face.
Souvent, ça ne pose pas de problème et les gens disent oui. Je sais que je ne peux pas forcer les gens et là où je n'ai aucun pouvoir là-dessus, c'est dans les lieux publics.
Par exemple, à l'université, je sais que c'est à moi de m'isoler dans mon coin avec mon masque et d'aérer régulièrement les lieux, puisque les autres étudiants ne le portent pas et qu'ils n'ont plus aucune notion des "gestes barrières".
Après voilà, c'est devenu... Aléatoire et chacun fait comme il le souhaite.
TSA sans déficience intellectuelle et sans altération du langage + trouble anxiodépressif associé - CRA régional (2021)
Ce n'est qu'en essayant continuellement que l'on finit par réussir.
Plus ça rate, plus on a de chances que ça marche. ~ Les Shadoks
Je continue de porter un FFP2 dans les transports, les magasins, au ciné, au boulot dès que je dois voir quelqu'un, etc.
Il m'arrive d'être la seule masquée dans tout le bus ou le wagon de métro, je m'en fous.
Le porter ne me gêne pas du tout. En effet, je dois quelquefois répéter ou bien articuler, mais c'est tout.
C'est tellement simple, j'ai du mal à comprendre pourquoi tant de gens ne le font pas, au moins dans les endroits bondés et pas aérés.
TSA (diagnostic par psychiatre spécialisée, septembre 2020)
"Le plus clair de mon temps, je le passe à l'obscurcir, parce que la lumière me gêne." Boris Vian
Petronille a écrit : ↑lundi 14 novembre 2022 à 14:40
Je continue de porter un FFP2 dans les transports, les magasins, au ciné, au boulot dès que je dois voir quelqu'un, etc.
Il m'arrive d'être la seule masquée dans tout le bus ou le wagon de métro, je m'en fous.
Le porter ne me gêne pas du tout. En effet, je dois quelquefois répéter ou bien articuler, mais c'est tout.
C'est tellement simple, j'ai du mal à comprendre pourquoi tant de gens ne le font pas, au moins dans les endroits bondés et pas aérés.
Exactement comme toi ! Sauf que moi, j'ai plus de mal avec le regard des autres et j'ai pas encore retenté le train... C'est en projet.
Quand je reçois des gens à domicile, pour le moment, jusqu'à maintenant, je les recevais en extérieur, sur ma terrasse et masqués... Je sais pas trop comment je vais me débrouiller avec le froid et l'arrivée de l'hiver...
TSA sans déficience intellectuelle et sans altération du langage + trouble anxiodépressif associé - CRA régional (2021)
Ce n'est qu'en essayant continuellement que l'on finit par réussir.
Plus ça rate, plus on a de chances que ça marche. ~ Les Shadoks
