Lorsqu'il y a suspicion d'un loup dans un territoire encore inhabité par un loup, si il y a des observations témoin, piège photo, attaque du bétail, des analyse sont fait sur des poils ou des crottes retrouvé, éventuellement de la salive ou des poils retrouvé sur le bétail si il y a eu une attaque (plus fréquent si le loup est seul que si il est en meute, d'autant que les troupeaux sont mal protégé dans les endroit "sans loup"), ou encore directement sur l'animal si il a malheureusement été abattu (braconné)... Les échantillons génétiques sont séquencé comparé avec des séquences génétique "de référence" sur des loup Français, italien, polonais, pour voir si il s'agit de loup "pure" et en déterminé sont origine, par rapport à des donnée connues. Les suspicions d'hybrides. Etc.
Les comptages sont fait dans les réserves...