https://spectrumnews.org/opinion/q-and- ... cond-hits/
Comme je suis nulle en Anglais j'ai eu le droit à une petite traduction que je copie aussi.
Spoiler : :Petite traduction d'un entretien avec Thomas Bourgeron de l'Institut Pasteur sur l'importance d'analyser les genomes de personnes portant des mutation et deletions importantes mais qui ne presentent pas de phenotypes ainsi que pousser la recherche sur les variantes genetique a risque. "
Pour construire une liste de gènes ayant des liens définitifs à l'autisme - 65 et le comptage - Les chercheurs recherchent des mutations qui surgissent chez les enfants autistes, mais pas chez leurs parents, frères et sœurs qui ne sont pas touchés. Mais ces rares mutations nuisibles ne sont qu'un morceau du casse-tête génétique complexe de l'autisme. Ils n'expliquent pas, par exemple, pourquoi l'autisme courre dans des familles, ou pourquoi deux personnes avec la même mutation peut avoir des caractéristiques très différentes.
Thomas Bourgeron, professeur de génétique à l'Institut Pasteur à Paris, fait partie d'un groupe de chercheurs qui prennent un second regard sur les personnes qui portent une mutation dans un gène nocif de l'autisme connu. Les scientifiques excluent souvent ces personnes des études sous l'hypothèse que la cause génétique de leur autisme a déjà été identifié, dit-il. Bourgeron dit qu'analiser leurs génomes peuvent révéler des mutations supplémentaires ou «deuxième hits» qui aident à expliquer comment l'autisme est héréditaire et pourquoi il est si diversifié.
Nous avons demandé à Bourgeron comment peindre une image plus détaillée du paysage génétique de l'autisme aiderait à faire progresser le domaine.
Spectrum: Pourquoi les scientifiques devraient chercher des mutations supplémentaires chez les personnes atteintes d'autisme qui ont déjà un diagnostique génétique?
Thomas Bourgeron: Notre risque génétique est comme une peinture qui se compose de petits points. Sortez un point etil n'y aura pas beaucoup de changements, mais tous ces points forment ensemble un tableau significatif.
Le domaine de l'autisme a progressé si rapidement; c'est vraiment étonnant. Mais la plupart du temps nous avons une colonne attachée à l'information génétique qui dit si oui ou non un individu est atteint d'autisme: Et parfois, quand nous sommes chanceux, nous avons le quotient intellectuel (QI). Mais derrière ces colonnes, il y a une personne.
Si l'on considère seulement qu' une colonne diagnostiquant l'autisme: oui ou non - il est facile de dire que nous avons trouvé la mutation qui a provoqué que l'autisme.
Mais les personnes autistes peuvent avoir de l'épilepsie, oui ou non; problèmes de sommeil, oui ou non; problèmes gastro-intestinaux, oui ou non. L'autisme lui-même n'est pas : oui ou non. Certains enfants présentant des mutations de SHANK3 sont gravement touchées et peuvent à peine parler, et certains vont à l'université. Des résultats génétiques supplémentaires peuvent-ils expliquer cette diversité génétique?
S: Est-ce que ce domaine embrasse cette complexité dans l'autisme?
TB: Je tiens à dire, comme une plaisanterie, que j'ai mes amis monogéniques et mes amis polygéniques. Mes amis monogéniques recherchent une forte cause génétique unique dans chaque individu. Ils trouvent une mutation rare chez un enfant affecté et un frère non affecté et disent: «Ceci est un gène de l'autisme."
La plupart de mes amis monogéniques sont des cliniciens qui ont un patient en face d'eux et veulent être sûrs et certains quand ils parlent de risque génétique.
Mes amis polygéniques ne se soucient pas de ces mutations rares parce qu'ils n'expliquent pas pourquoi l'autisme coure dans des familles. Ces mutations spontanée ou de novo, ces variantes n'expliquent l'héritabilité de l'autisme. Des études ont montré que le risque de l'autisme peut etre hérité, alors d'où vient cette heritibalite ?
La réponse complète un casse-tête génétique de l'autisme qui réside dans le fait qu'il ya des millions de variantes génétiques. Nous devons penser le génome comme un paysage diversifié et regarder chaque variante génétique, si elle a des effets grands ou petits. variantes communes, celles qui sont fréquentes dans la population, ajouter le poids, la taille, le QI et les caractères quantitatifs tels que le volume du cerveau. Ces variantes jouent également un grand rôle dans l'autisme. Mais elles le font collectivement, et non individuellement. Et, à ce jour, pour l'autisme, nous ne savons pas où ells se situent ou comment mesurer leurs effets.
S: Y at-il un danger à parler de «gènes de l'autisme, parce que le terme implique que les cliniciens ne devraient pas chercher plus loin qu'un seul gène?
TB: C'est exactement la question que je explorer. Un jour, je reçois un fichier Excel avec une liste d'individus à inclure dans une étude de séquençage. A côté de plusieurs de ces patients, il est dit «exclus». Je demandai à mon collègue pourquoi ils ont été exclus, et elle a dit: «Parce que vous avez déjà trouvé le gène de l'autisme dans cette famille."
Je me suis alors décidé deseulement travailler sur ces familles «exclus». J'ai maintenant la séquence du génome entier d'environ 20 d'entre eux. Certains d'entre eux ont un diagnostique de mutation genetique, comme une mutation dans SHANK3. Mais je pense qu'il est important de dire, "OK, nous avons SHANK3, mais il y a -t-il autre chose?" Si vous ne regardez pas, vous ne le trouverez pas.
S: Qu'avez-vous trouvez?
TB: Ce projet est en cours, mais nous ne trouvons d'autres mutations. Même dans les familles qui ont deux enfants atteints d'autisme, parfois un frère aura une mutation du gène perturbant cliniquement. Mais son frère, qui a aussi autiste, porte une mutation complètement différente. Nos résultats reproduisent ceux d'une autre analyse de la séquence du génome entier de frères et sœurs atteints d'autisme publié l'an dernier.
S: Des résultats génétiques supplémentaires pouraient-ils contrer les effets d'une mutation connu de l'autisme ?
TB: J'appelle ces gens «Le résilients» ou les super-héros. Parfois, je vais voir une grande délétion chromosomique ou mutation cliniquement pertinente chez un individu et de penser, "OK, il a une déficience intellectuelle ou de l'autisme." Mais il se trouve qu'il est le père inaffecté ou un frère de quelqu'un avec de l'autisme, ou un «contrôle. '
Plus nous séquençons ces «contrôles», plus nous voyons des gens qui ont une mutation si forte que nous allions assumer que ce soit la cause de leur autisme . Mais ce n'es pas le cas. Pourquoi des personnes peuvent porter de très fortes mutations et deletion?
Ma théorie est que certaines mutatio fonctionnent dans certains génomes, ou dans des environnements, mais pas d'autres. Imaginez jeter une cigarette dans les collines à L.A. en Août. La chance que cela va commencer un incendie est très élevé. Prenez la même cigarette et déposez-le à Seattle en Novembre et probablement rien ne se passera. La cigarette est la mutation, et certains génomes sont protégés.
Maintenant que nous connaissons les plus forts gènes a risque de l'autisme, il est temps de regarder à travers la population générale. La première étape consiste à identifier tout le monde dans l'autisme et de contrôle des bases de données qui porte une mutation forte, mais avec le père inaffecté, mère, frère ou soeur de quelqu'un avec de l'autisme. Il serait problematique pour la science que les personnes qui ne sont pas autistes portent une mutation d'un gene a risque de l'autismeBonjour. Mais au lieu de voir cela comme problème, je vois cela comme une opportunité"
