Ok

En fait est-ce que tu devras cibler ou pas, ça dépend de la discipline de la thèse: si tu étais en pharmaco-vigilence par exemple, effectivement tu devrais cibler ton étude sur une molécule en particulier (comme le Bisphénol A) et imaginer une méthodo pour tester ton hypothèse de travail.
Mais imaginons que la discipline dans laquelle tu t'inscrit c'est je sais pas moi, la sociologie, tu pourrais étudier (je dis un truc complétement au hasard) la sociologie des pouvoirs publics et des hautes autorités en relation avec les risques liés aux médicaments (et donc chercher à comprendre si oui ou non ils sont laxistes ou s'il y a de vrais mécanismes qui nous protègent).
Et là, tu pourrais avoir une approche beaucoup plus transversale.
(enfin socio j'en sais rien, ça pourrait aussi être le droit, ou l'économie, ou d'autres disciplines... c'est un sujet qu'on pourrait étudier de manière très interdisciplinaire je crois

).
A toi de voir dans quelle discipline tu es assez compétente pour poser une question de recherche pertinente et avec laquelle tu pourras répondre avec les outils dont tu disposes. Mais c'est très important de garder en tête qu'une thèse ne peut généralement être que dans une seule discipline (même une thèse qui s'inscrit dans une thématique interdisciplinaire... je sais c'est pas évident à cerner

... en gros, un travail de recherche interdisciplinaire ne peut être qu'un travail d'équipe, où chaque spécialiste participe à l'étude en apportant les outils de sa spécialité... car il faut rester dans sa spécialité pour rester crédible.
(je sais qu'il y en a qui vont me dire qu'il y a des mathématiciens ou des physiciens qui se mettent à faire de la biologie ou autre, mais en fait non, il restent des praticiens de leur discipline tout en appliquant leurs outils à une discipline différente, donc ça marche pas comme contre exemple

)
(j'insiste sur ça car moi je vois plein d'étudiants de sociologie qui font l'erreur de penser que parce que par exemple ils travaillent sur un projet global qui s'intéresse à "l'efficacité des plantes médicinales traditionelles", ils doivent tirer des conclusions sur l'efficacité des plantes médicinales traditionelles... or non, pour un sociologue, ce qui serait pertinent c'est par exemple d'étudier la perception qu'on les populations de l'efficacité des plantes médicinales traditionelles, ce genre de choses... c'est un exemple réel).